Zarodniki bakterii są zaprojektowane przez naturę tak, aby przetrwać w niekorzystnych warunkach chemicznych i fizycznych, które szybko zabiłyby inne formy życia.
Wynika z tego, że chemikalia i procedury, które mogą zabić zarodniki, są z konieczności wysoce śmiercionośne dla mniej odpornych komórek, w tym takich, które są obecne w tkankach ludzkich, zwierzęcych i roślinnych. Najpowszechniej stosowanymi środkami bakteriobójczymi są chlor, jak w roztworach podchlorynu lub wybielaczu, i formaldehyd, przy czym do niektórych zastosowań wykorzystuje się nadtlenek wodoru i inne środki utleniające, jak ozon. Jednak takie środki dezynfekujące w stężeniach niezbędnych do ich skuteczności i niewłaściwie stosowane, są potencjalnie niebezpieczne dla zdrowia ludzkiego. 
Dlatego należy zachować ostrożność w trakcie ich stosowania, aby nie dostały się do skóry lub oczu, a zwłaszcza w przypadku aldehydów, aby ich nie wdychać.
W przypadku fumigacji prace powinny być wykonywane wyłącznie przez przeszkolonych fachowców posiadających odpowiednią odzież ochronną i aparat oddechowy. Ostrożne obchodzenie się ze stężonymi płynnymi środkami dezynfekującymi, o których mowa, ma ogromne znaczenie dla bezpieczeństwa ludzi, dlatego należy nosić także rękawice i fartuchy lub kombinezony, a także okulary ochronne lub gogle na oczy, aby zapobiec kontaktowi tych środków ze skórą lub oczami. Wszystkie pojemniki ze środkami dezynfekującymi powinny być odpowiednio i dokładnie oznakowane co do ich zawartości, ponieważ w pewnych okolicznościach nadtlenki mogą być wybuchowe. Nadtlenek wodoru, chociaż jest najbardziej akceptowalny z punktu widzenia ochrony środowiska, wymaga skomplikowanej aparatury i procedur oraz ma inne czynniki ryzyka, w szczególności niebezpieczeństwo wybuchu, o których należy pamiętać. Jeśli musisz odkazić powierzchnie i pomieszczenia, zobacz co dezynfekcja Mińsk Mazowiecki może dla ciebie zrobić. Personel dezynfekujący lub odkażający zamknięte przestrzenie oraz podczas otwierania takich miejsc w celu przewietrzenia ich po zakończeniu procedury dezynfekcji lub fumigacji powinien nosić odpowiednie respiratory chemiczne.